工程博士和普通博士，专业学位与学术型学位处于同一层次，培养规格各有侧重，在培养目标上有明显差异。学术型学位按学科设立，其以学术研究为导向，偏重理论和研究，培养大学教师和科研机构的研究人员;专业学位以专业实践为导向，重视实践和应用，培养在专业和专门技术上受到正规的、高水平训练的高层次人才。
工学博士就是通常说的博士了，考试入学，主要是学校培养，在学校全日制学习。工程博士是由高等学校与企业联合培养，符合资质的需要有企业和学校推荐书，毕业后可参与国家重大项目建设工作。
“两个学位是同一层次，不同类型。”曾参与工程博士学位论证和调研工作的北京理工大学研究生院副院长李镇，多次在不同场合强调工学博士与工程博士的异同，前者侧重理论研究，后者注重工程实践，但要求都很高。
工程博士研究生实行校企联合培养的方式，课程体系根据培养对象的特点和培养目标要求设计，实行多学科交叉培养和导师团队联合指导。
学位论文工作与解决重大工程技术问题、实现企业技术进步和推动产业升级紧密结合，学位论文能反映学位申请者的贡献及创造性成果。工程博士研究生学习期满、修满培养方案规定学分、成绩合格，在导师指导下独立完成学位论文后，可申请在组织的论文答辩，通过论文答辩。
学位论文由学校导师与企业或行业具有高级职称的资深专家组成专家组联合指导，选题直接来源于相关国家重大科技专项课题或企业生产实际中重大关键问题。学位论文工作与解决重大工程技术问题、实现企业技术进步和推动产业升级紧密结合，学位论文能反映学位申请者的贡献及创造性成果。
对修满规定学分、课程考试与工程实践合格且学位论文答辩通过者，经过学位评定委员会审议通过后，授予博士毕业证书和工程博士专业学位,工程博士专业学位证书格式由国务院学位委员会办公室制定。