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销售设备能不能给分公司开发票
根据《国家税务总局关于加强增值税征收管理若干问题的通知》(国税发〔1995〕192号)第一条第(三)款规定，购进货物或应税劳务支付货款、劳务费用的对象。纳税人购进货物或应税劳务，支付运输费用，所支付款项的单位，必须与开具抵扣凭证的销货单位、提供劳务的单位一致，才能够申报抵扣进项税额，否则不予抵扣。
另外，根据《国家税务总局关于修订<增值税专用发票使用规定>的通知》(国税发〔2006〕156号)第十一条规定，专用发票应按下列要求开具：
(一)项目齐全，与实际交易相符;
(二)字迹清楚，不得压线、错格;
(三)发票联和抵扣联加盖财务专用章或者发票专用章;
(四)按照增值税纳税义务的发生时间开具。
对不符合上列要求的专用发票，购买方有权拒收。
因此，发生增值税业务时，不得将发票开具给除实际购买方以外的其他单位。
分公司能否给总部开具增值税专用发票
《财政部、国家税务总局关于将铁路运输和邮政业纳入营业税改征增值税试点的通知》(财税[2013]106号)附件1《营业税改征增值税试点实施办法》第四十二条规定，增值税纳税地点为：
(一)固定业户应当向其机构所在地或者居住地主管税务机关申报纳税。总机构和分支机构不在同一县(市)的，应当分别向各自所在地的主管税务机关申报纳税;经财政部和国家税务总局或者其授权的财政和税务机关批准，可以由总机构汇总向总机构所在地的主管税务机关申报纳税。
根据上述规定，如果分公司确实为总公司提供了增值税应税劳务，且总分公司不在同一县(市)的，则分公司应当在其机构所在地申报纳税，并根据提供劳务的内容开具增值税专用发票。
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