有人认为纳税评估与税务稽查区别就在于不下企业、不查帐。这完全是一种错误的认识，纳税评估的约谈举证、实地核查都需要调查纳税人相关账务，而实地核查更是纳税评估不可或缺的一个重要环节。
区分纳税评估与税务稽查，首先要区别税务税稽查与税务检查的差异。
税务稽查不等同于税务检查，稽查是一项业务职能，检查是一种工作手段。税务稽查以打击税务违法行为、震慑违法企图为目的，而纳税评估则是通过对纳税人纳税结果的分析找出形成结果的原因并提出解决的方法，目的在于提出管理措施，提高管理水平。因此无论是税收评估还是税务稽查，为了达到各自的目的，都应充分应用征管法等有关法律法规赋予的征管手段，而不应自我限制、自缚手脚。