1. 收入类项目的风险
（1）收入核算不准确，包括人为的调整纳税期间的收入发生时间。
（2）企业所得税收入与其他税种收入存在较大差异，没有按照国税函[2008 ]875号文的要求确认企业所得税的收入。
（3）取得手续费收入，未计入收入总额，包括代扣代缴个人所得税取得手续费收入。
（4）取得补贴收入，未正确区分是否为应税收入。不征税财政收入要求专款专用，单独记账，到当地税务机关备案。
（5）取得收入挂在往来账上不计收入。
2. 扣除类项目的风险
（1）限额扣除类项目，未按照税法规定标准扣除，包括业务招待费、职工福利费等。
（2）营业成本核算不准确，包括工资薪金和产品成本。
（3）收购发票开具不合规，不能在税前扣除。
（4）取得发票虽然票面没有问题，但与实际经营不符而多进成本。
（5）应视同工资薪金的各种劳动报酬支出，未做纳税调整，造成福利费等计算限额的基础发生差错。
（6）支付与取得收入无关的其他支出，包括与企业无关人员的飞机票、旅游门票等。
（7）成本费用未通过正确科目核算，比如发生一些福利性质的费用，未通过职工福利费科目核算，也未并入福利费总额计算纳税调整。
（8）建造、购置固定资产发生的应予资本化的利息支出，作为财务费用税前列支，未作纳税调整。
（9）不允许扣除项目。包括赞助支出、行政罚款、税收滞纳金、除相关文件明确的准备金，资产减值准备等。
（10）研发费用加计扣除不符合规定，包括虚列项目，项目不符合三新范围，扩大扣除范围等。
（11）应由个人负担的费用作为企业发生费用列支，为职工支付不得税前扣除的商业保险，包括为职工支付人身意外险。?
3. 亏损弥补的风险
弥补和结转亏损的数据是否与征收系统的数据一致，是否按规定弥补以前年度亏损额和结转以后年度待弥补的亏损额。
4. 资产类项目的风险
（1）资产减值损失准备。不符合国务院财政、税务主管部门规定的各项资产减值准备、风险准备等准备金支出，不得税前扣除。
（2）资产损失扣除。经营过程中发生了资产损失，应该按照文件的规定，分类进行资产损失清单申报或资产损失专向申报，作为年度申报表的附报资料到办税服务厅进行申报，然后才能进行年度纳税申报表的填报。
（3）公允价值变动收益。企业持有各项资产期间资产增值或者减值，除国务院财政、税务主管部门规定可以确认损益外，不得调整该资产的计税基础。
5. 税收优惠的风险
企业所得税优惠目前分为审批类、备案类。纳税人的经营项目或所得如果属于审批类或备案类，应事先向主管税务机关提出申请或备案，经税务机关登记核准后，才可以享受税收优惠。纳税人未按规定审批或备案的，一律不得享受减免税。因此，审批或备案是企业享受企业所得税优惠的先决条件。
6. 关联交易的风险管控
按照税收相关规定，企业与其关联企业之间的业务往来，应当按照独立企业之间的业务往来收取或者支付价款、费用；不按照独立企业之间的业务往来收取或者支付价款、费用，而减少其应纳税的收入或者所得额的，税务机关有权进行合理调整。