金税三期工程新建系统包括核心征管、个人税收管理、决策支持1包、决策支持2包、纳税服务、外部交换、应用集成平台、安全策略2包等系统。
金税三期系统特点：实现业务规范统一化，覆盖全业务，简化涉税事项，加强纳税遵从风险管理，实现信息共享和外部涉税信息管理，实现了跨税种、跨纳税环节的信息共享。
对企业的影响：
1、销项发票开出都要在公司的实际经营范围之内。
2、商贸流通企业进项发票的品名必须与销项发票的品名匹配起来，包括数量，单位，货物名称。
3、对于之前已经认证的进项发票，如果不符合规定也将受到核查，一旦查出，会要求进项转出补交全部税款。
4、购货合同、销货合同、送货单、入库单等交易凭据要准备齐全备查。
5、税务系统内有数据勾稽、预警分析，企业应该规范自己的账务处理。