纳税人多缴的印花税款能否办理退税或抵缴，要根据具体的缴纳方式来确定：在“三自纳税”(纳税人在书立、领受应税凭证时，自行计算应纳印花税额，向当地纳税机关或印花税票代售点购买印花税票，自行在应税凭证上一次贴足印花并自行注销。)方式下，多贴印花税票的，不得退税或抵用;在按期汇总纳税方式下，多缴纳的印花税款，应允许按税收征管法相关规定和主管税务机关的要求，办理退税或抵缴。
《印花税暂行条例》第七条规定，应纳税凭证应当于书立或者领受时贴花。《印花税暂行条例实施细则》第二十一条规定，一份凭证应纳税额超过五百元的，应向当地税务机关申请填写缴款书或者完税证，将其中一联粘贴在凭证上或者由税务机关在凭证上加注完税标记代替贴花。第二十二条规定，同一种类应纳税凭证，需频繁贴花的，应向当地税务机关申请按期汇总缴纳印花税。第二十三条规定，凡汇总缴纳印花税的凭证，应加注税务机关指定的汇缴戳记、编号并装订成册后，将已贴印花或者缴款书的一联粘附册后，盖章注销，保存备查。第二十四条规定，凡多贴印花税票者，不得申请退税或者抵用。
根据上述规定，印花税是一特殊税种，只对特定凭证及行为贴花，应纳税凭证应当于书立或者领受时按所载的金额计税贴花。对同一种类应纳税凭证需频繁贴花或应纳税额超过五百元的，法规特别规定可申请按期汇总填写缴款书或者完税证，属于印花税特殊的计税办法。签订合同时的合同金额与最终合同执行时的执行金额不一致的，按上述规定不需要调整，但根据《印花税暂行条例》第九条的规定，如果已贴花的凭证进行了修改，修改后所载金额增加的，其增加部分应当补贴印花税票。目前为止对多贴印花税票者，仍不得申请退税或者抵用。
多交印花税，怎么办理退税？
可以申请退税。和你企业的分管税务官员联系，一般的程序如下：
1、申请书-关于要求退还印花税的申请。
2、税票正本2份
3、企业营业执照复印件副本。
4、法人章、法人代表章
4、办税员证
到办税大厅填具表格，由税管员签字，分管局长签字，即可办理退税。
退回的印花税如何做分录？
企业交纳的印花税，是由纳税人根据规定自行计算应纳税额以购买并一次贴足印花税票的方法交纳的税款。
企业交纳的印花税，不会发生应付未付税款的情况，不需要预计应纳税金额，同时也不存在与税务机关结算或清算的问题，因此企业交纳的印花税不需要通过应交税费科目核算，于购买时直接借记管理费用科目，贷记银行存款或库存现金科目。
如果多交：
借：库存现金或银行存款
贷：管理费用
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