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一般纳税人注销时存货怎么处理？根据财政部、国家税务总局《关于增值税若干政策的通知》(财税【2005】165号)第六条规定，一般纳税人注销或被取消辅导期一般纳税人资格，转为小规模纳税人时，其存货不作进项税额转出处理，其留抵税额也不予以退税。因此，一般纳税人办理注销时，库存未实现销售不需要补税。但对库存不实或对库存进行清理分配的，应按规定缴纳增值税。
一、一般纳税人在企业注销时的存货处理方法
一般纳税人企业申请注销税务登记时，如果企业销项税金大于进项税金，并且按注销企业的有关政策规定交纳增值税后，企业还有存货余额的，其存货余额部分应按存货的适用税率计算补交已抵扣的税款，因为存货在当初购进时其进项税金已作了抵扣，减少了当期应交税金，既然现存货已经退出了企业的经营活动，所以要对先期已抵扣的进项税进行调整。
企业依法注销同时取消增值税一般纳税人资格，说明企业将不再存续，此时清算应注意，企业对所有的资产包括存货是如何处理的，如果分配给股东或投资者，则应视同销售；如果无偿赠送他人，则应视同销售；如果已没有使用价值而废弃或盘亏，应作非正常损失，作进项税额转出，补缴税金。
小规模纳税人在企业注销时的存货怎么处理？由于小规模纳税人企业在政策上的特殊性，因此小规模纳税人企业购进货物无论是否取得增值税专用发票，其支付的增值税额均不得进入进项税额，不得由销项税额抵扣，而应计入购货成本。因此，经核实其存货属正常范围的(即平时税负正常，存货帐实相符，无虚假)，不应作进项税转出或计提销项税等征税处理。小规模纳税人企业注销时，其存货不作纳税调整。
一般纳税人注销时存货怎么处理？综上所述，一般纳税人企业注销时，要存货商品是否和账面库存相同。如果是账面存货大于实际的存货，那需要补交增值税；如果小于实际存货，退货到销货方；如果两者数据相同，则不需要补交增值税。所以一般纳税人注销时存货处理，还需要结合实际情况。