计入当期损益，当然在当期就最终转入了“本年利润”。
而计入“制造费用”，还需要通过产品核算的归集与分配程序，先转入“生产成本”，其次再转入“产成品”，最后等到产品销售或其他用途耗用后，转入“主营业务成本”或费用等，当然最终也是转入了“本年利润”。前述的过程，可能是在一个会计期间完成，也可能是多个会计期间完成。
计入当期损益，属于费用化；计入“制造费用”或“生产成本”，属于资本化。因此，二者性质上不同，对于会计利润的影响可能存在时间差异。
由于对于费用化与资本化的区分，在税务方面并没有做明确规定，税务处理在没有明确规定的情形下，可以按照会计处理结果执行。因此，对于停工损失的税务处理在满足税法规定的前提下，是可以会计处理执行的。同时，国家税务总局公告2011年第25号也规定，对于实际发生的资产损失，只有会计上已经做了损失处理的年度才能申报扣除。
因此，对于自然灾害造成的停工损失计入当期损益，可以在当年度按照规定申报扣除；对于资本化的，只能等到产品被耗用或销售后，才能按照规定申报扣除，如果当年度产品没有被耗用或销售的，是不能税前扣除的。