审计报告的编制应该做到要素完备、意见准确、证据充分以及内容合法。
其中，要素完备指注册会计师编制审计报告的基本要素齐全，缺一不可，包括标题，收件人，引言段，责任段，审计意见段，注册会计师的签章，事务所的名称、地址及盖章，报告日期；意见准确指注册会计师在审计报告中应真实地反映审计的情况，通过审计报告将审计意见确切地传达给报告使用者；证据充分指注册会计师所取得的审计证据足以支持审计意见，减少审计风险；内容合法指注册会计师编制和出具审计报告必须符合《中华人民共和国注册会计师法》和《独立审计准则》的规定。
编制审计报告的主要步骤：
在审计报告阶段，为了编制和出具审计报告，注册会计师应遵循以下工作步骤，认真地完成每一步骤上的全部工作，最终出具一份合法的审计报告，以满足社会需要。
第一步，编制审计差异调整表。包括：调整分录汇总表、重分类分录汇总表、未调整不符事项汇总表等。
第二步，判断和运用重要性水平，主要是将被审计单位未调整不符事项汇总表与会计报表层次或账户余额层次的重要性水平进行比较，据以确定未调整不符事项对会计报表的影响程度。
第三步，解决重要差异。注册会计师确定审计差异之后，一般应与被审计单位沟通，建议其做出相应的调整，如果被审计单位拒绝调整那些重大差异，注册会计师必须考虑改变审计意见和在审计报告中如何反映的问题。
第四步，进行审计小结。注册会计师应就有关审计事项进行小结，编制审计工作完成情况表，并明确地评价和说明审计计划的执行情况以及审计目标是否实现，写入审计小结中。通常审计小结文书应包括审计概况、审计中发现的主要问题和情况、意见和建议、审计结论等内容。审计小结是一份重要的审计工作底稿，它是对审计工作中各种信息的综合提炼。注册会计师应对审计小结进行认真审核，并妥善保管。
第五步，编制试算平衡表。
第六步，提请被审计单位调整会计报表，审核会计报表及其附注。其中，会计报表附注包括公司简介、会计政策、报表项目注释、分析情况以及重要事项揭示五个部分的内容。如果注册会计师代为编制会计报表及附注，不能将附注事项与应在审计报告揭示的事项混为一谈，即不能因为注册会计师代替被审计单位编制报表附注，而不在审计报告中揭示那些应予揭示的事项。
第七步，确定审计意见。注册会计师根据对所取得各种审计证据的分析和评价结果，结合重要性水平，确定应在审计报告中发表何种审计意见。
第八步，草拟审计报告。
第九步，复核审计工作底稿。这里主要指进行重点复核和全面复核，如果复核中发现存在遗漏问题，应返回到审计实施阶段补充审计，如果复核中发现问题处理不当，应返回至编制审计差异表这一步骤，对不正确的处理意见做出适当的修订。
第十步，出具审计报告。经复核确认后，注册会计师应将审计报告草拟稿送至被审计单位管理当局经确认后，再正式签发并出具审计报告。