简单来说，分包扣除就是一种利用法律规定的手段，对企业的税负进行管理的办法。企业委托承包商来完成某项工程，如果这个工程又可以分成几个部分进行完成，那么企业就可以将不同的部分分别委托给不同的承包商，每位承包商都按照自己的合同范围进行施工，并且把每个承包商的费用进行分摊扣除，从而降低企业税负。
那么分包扣除的会计分录是怎样的呢？需要根据实际操作场景进行设置，一般的会计分录包括：借：分包合同款——应扣除分包工程款项；借：增值税进项税额——分摊增值税进项税额；借：应付工程款——分摊扣减后的工程款；借：待摊费用——分包业务相关的直接费用等；贷：银行存款——代付分包款项。这样，就可以实现正确的分包扣除，并且让企业的税负得到合理的缓解。
虽然分包扣除政策对企业来说是一种利好，但是在实际操作中，企业需要注意一些问题。首先，企业需要确认分包承包商的实际承担范围，查明其承担的分包工程在总合同工程中所占的比例。其次，企业需要建立健全财务管理体系，及时更新分包承包商的税务登记信息，并将分包扣除的相关证照妥善保管备查。此外，企业需要严格遵守相关法律法规，不能将分包合同用于规避税收，不得通过虚构合同等手段骗取分包扣除的优惠政策。
综上所述，分包扣除是企业降低税负、提高经济效益的一种重要手段。在使用此项优惠政策时，企业需要关注政策变化，掌握税收政策的最新动态，避免因为政策调整而导致不必要的经济损失。此外，企业也需要完善自身管理，遵守相关法律法规，确保分包扣除的合规性和透明性。只有这样，分包扣除政策才能真正成为企业提高竞争力、促进发展的重要支撑。