首先，专票的开具比普票更为繁琐。专票是由税务部门直接分配给企业的，只能在特定的情况下使用。同时，企业还需要在税务部门登记自己的专票使用资格，才能开具专票。这种方式确保了专票的准确性和可追溯性，也提高了税务机关的监管效率。
相比之下，普票的使用门槛较低。普票一般由购买者向销售者索要，并由销售者在购买者需要的情况下开具。普票的开具流程相对简单，也不需要像专票一样进行资格登记。因此，普票更加方便快捷，也更适合一般的交易场合。
另一方面，专票和普票也存在着不同的用途。专票主要用于一些特殊领域，如建筑和机械设备等。这些领域的交易规模较大，一般需要发票作为凭证来核算和管理交易。而普票则适用于一般的零售、批发和服务行业，如超市、餐饮和理发等。实际上，普票的使用范围更广，也更加常见。
最后，专票和普票在开票的税率和纳税方法上也有一些区别。专票开具时，可以采用按预征率直接扣税或者“收入-费用=利润”的方法计算纳税。而普票则仅能按照销售金额和税率的乘积计算纳税金额，没有其他方法。这也是专票在一些行业，如建筑和机械设备，被广泛使用的原因之一。
总的来说，虽然专票和普票都属于发票，但是它们在使用门槛、用途和纳税方法等方面都存在着差异。企业在开具发票时，需要根据具体情况选择合适的种类，以确保交易的合法性和准确性。