首先，企业进行直接计入费用增值税发票入账时，需要保证发票的真实性和合法性。只有合法有效的增值税发票才能作为企业的财务凭证。
其次，企业需要根据税务部门要求，对增值税发票进行分类。一般分为17%税率和13%税率两个类别。企业需要根据购买的商品或者服务的税率，把增值税发票划分为相应的分类。
接下来，企业需要选择对应的凭证类型进行入账。对于直接计入费用的增值税发票，一般选择“费用”类凭证。具体来说，应将增值税发票的金额分别归入到“营业税金及附加”科目和相关的费用科目中。
此外，企业还应该对增值税发票进行核对和审核。首先，核对发票内容，确定发票上标明的商品或者服务是否与实际购买的一致。其次，审核发票的金额是否与交易时的金额一致，确保发票的合法性以及实际发生的交易纪录准确无误。
最后，企业需要在财务记录中进行增值税发票的汇总。这些记录要与税务部门签订的税收合同相对应，确保税收的合法性和准确性。此外，在进行增值税发票汇总时，需特别注意汇总时间点，确保准确记录发票的收入和支出情况，以便后期进行进一步的管理和决策。
综上所述，直接计入费用的增值税发票如何入账，对于企业而言非常重要。通过科学的入账处理，可以有效地保证企业财务信息的准确性和合法性，同时为企业的财务管理提供有效的支持。