1.它们使用的发票不同。
一般纳税人不但可以收普通发票，更可以收增值税专用发票，小规模纳税人就一般只能使用普通发票，不过小规模纳税人在购买货物的时候也可以收增值税发票，只是它们在增值税专用发票的处理不同，一般纳税人是按价格款项的部分入成本，税款部分入：“应交税金——应交增值税——进项税额"帐户”，而小规模纳税人是按全额进入成本的。
2.它们的税率不同。
一般纳税人一般有三个税率：6%、11%、17%，并且还可以抵扣增值税专用发票。小规模纳税人税率是3%，并且小规模纳税人不达到金额要求可以免税。
3.它们缴税金额的计算方法不同。
一般纳税人是按“抵扣制”的方法来计算税金的，也就是说，按销项减进项后的余额来交税。而小规模纳税人则是按照销售收入/（1+使用税率）得到的金额再乘于3%的税率来交税的。
4.它们的认定条件不同。
如果从事生产或提供应税劳务的，年销售额达到50万的可就必须要认定申请为一般纳税人，50万以下仍旧可以是小规模。
如果主要从事货物批发零售的，年销售额80万以上必须要认定申请为一般纳税人，没达到这个标准的则为小规模纳税人。
认定条件：1.主要从事生产或提供应税劳务（特指加工、修理修配劳务）的：年销售额在50万元以上的，可以认定为一般纳税人，50万以下的为小规模；
2主要从事货物批发零售的：年销售额80万以上的可以认定为一般纳税人,80万以下为小规模。工业企业年销售额在50万以下的,商品流通企业年销售额在80万以下的,属于小规模纳税人;反之为一般纳税人。营改增类年销售额500万，未到500万的为小规模。
新开办的企业如何判断它是一般纳税人还是小规模纳税人?
小规模纳税人是指年销售额在规定标准以下，并且会计核算不健全，不能按规定报送会计资料，实行简易办法征收增值税的纳税人。具体来说，符合以下条件之一的，就属于小规模纳税人：
（1）年应税销售额未超过50万元的工业企业。工业企业，是指从事货物生产、加工、修理修配的企业及企业性单位，包括以工业生产为主，兼营货物批发、零售的企业及企业性单位。
（2）年应税销售额未超过80万元的商业企业。商业企业，是指从事货物批发、零售等商业经营活动的企业及企业性单位，包括以货物批发、零售为主，兼营工业生产的企业及企业性单位。
除此以外，还有三种纳税人也视同小规模纳税人，即：年销售额超过小规模纳税人纳税标准的个人（不包括个体经营者）；非企业性单位；不经常发生应税行为的企业。
增值税一般纳税人是中国大陆税种——增值税划定的开征对象之一。根据1994年3月15日中华人民共和国国家税务总局国税发（1994）第059号《增值税一般纳税人申请认定办法》的规定，界定的范围如下：
（1）凡年应税销售额超过小规模纳税人标准的企业和企业性单位，均为一般纳税人；
（2）非企业性单位如果经常发生增值税应税行为，并且符合一般纳税人条件的，可以认定为一般纳税人；
（3）年应税销售额未超过标准的（自1998年7月1日起，从事货物批发或零售的纳税人除外），从事货物生产或提供劳务的小规模企业和企业性单位，账簿健全、能准确核算并提供销项税额、进项税额，并能按规定报送有关税务资料的，经企业申请，税务机关可将其认定为一般纳税人；
（4）新开业的符合一般纳税人条件的企业，应在办理税务登记的同时申请办理一般纳税人认定手续；已开业的小规模企业，其年应税销售额超过小规模纳税人标准的，应在次年1月底以前申请办理一般纳税人认定手续。
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