土地储备资金应当作为独立的会计主体进行确认、计量和披露。土地储备资金应当独立于土地储备机构的固有财产及其管理的其他财产，实行分账核算。
土地储备资金的会计核算主要以权责发生制为基础，对土地储备项目应进行成本核算。
土地储备机构应当根据本办法的规定设置和使用会计科目、编制会计凭证、登记会计账簿，对土地储备资金进行会计核算。
土地储备资金核算土地储备资金各项收入与交付项目支出的差额。
期末，将各收入科目贷方余额转入本科目，借记"财政拨款收入"、"其他收入"科目，贷记本科目。将"交付项目支出"科目借方余额转入本科目，借记本科目，贷记"交付项目支出"科目。
本科目期末余额，反映土地储备资金各项收入与交付项目支出的累计差额。