首先，增值税普通发票适用范围相对较广。根据税务部门的规定，增值税普通发票可以适用于商品销售、广告服务、饮食服务、运输服务等众多领域。而增值税专用发票则仅适用于某些特定的行业和场合，例如，建筑业、电信业等。
其次，两种发票的开具方式也有所不同。增值税普通发票的开具规则比较简单，只需填写相关的税务信息即可。而增值税专用发票则需要满足更加严格的开具规则，开票人员需要根据税务部门制定的标准来开具。
此外，增值税普通发票可以作为企业购买办公用品等费用的必须凭证，在企业报销方面具有一定的作用。而增值税专用发票则更多地是针对企业之间的发票开具和交易。
最后，增值税专用发票与增值税普通发票在开具后的使用时间也有所不同。增值税普通发票一般有一个月的使用期限，在这个期限内可以进行开票相关的报销等工作。而增值税专用发票则需要及时进行使用，因为在开票后一定时间内未使用的话，可能就无法进行相关报销等操作，对企业的经营会产生一定程度的影响。
总之，增值税普通发票和增值税专用发票虽然在很多方面都有所不同，但对企业来说都是必不可少的。企业需要根据自身的实际情况来选择哪种类型的发票更加适合自己，并在使用过程中注意相关的操作规定，确保相关的税务工作能够得以顺利进行。