首先，在收到免税发票后，企业应该将其归入应付账款或其他应付款中。在这个时候，会计分录的借记方应该是其他应付款或应付账款，贷记方则是增值税或消费税。
其次，在账期结束后，企业需要进行免税发票的认证工作，即将免税发票的金额进行核实以及确认。在这个时候，会计分录的借记方应该是免税收入，贷记方则是其他应付款或应付账款。
另外，在向政府申请免税额度时，企业需要提供相应的免税发票。在这种情况下，会计分录的借记方应该是税前收入，贷记方则是财政补贴收入。
最后，在企业结算账期后，如果免税发票仍未得到认证，那么企业需要将其重新纳入到应付账款或其他应付款中。在这个时候，会计分录的借记方是增值税或消费税，贷记方则是其他应付款或应付账款。
综上所述，处理免税发票的会计分录应该根据具体情况进行相应的调整。但是无论哪种情况，企业都需要保持高度的注意，遵守相关的会计规定，确保账目的准确和清晰。
总之，对于企业而言，免税发票虽然可以为企业带来相应的经济利益，但是在处理免税发票时要注意各种会计分类以及税务规定，以避免对企业造成任何不必要的损失和麻烦。