首先，拍卖公司佣金收入属于企业经营性收入，应按照《中华人民共和国企业所得税法》的规定缴纳企业所得税。目前企业所得税税率是20%，按照收入减去成本后的净收入计算缴税额。
其次，拍卖公司在征收佣金时需要开具发票。在缴纳企业所得税时，拍卖公司可以选择直接使用佣金收入发票减免税款，也可以按照企业所得税缴纳时规定的程序申请开具发票后再减免税款。
同时，拍卖公司需要对所得佣金进行证明。拍卖公司应当在每年税务年度结束后，及时报送企业所得税汇算清缴申报表，并且在申报表中填报准确的销售收入、成本以及应纳税额等信息。税务部门对申报表进行核对后，拍卖公司缴纳企业所得税。
最后，需要注意的是，拍卖公司在缴纳企业所得税时还需要算进其他的税费。比如，增值税、营业税、印花税等等都需要按照税法的规定缴纳。此外，拍卖公司还需要加强税收管理，严格遵守财务会计准则，及时向社会公开企业财务信息，保证佣金收入的诚信合法性。
总之，拍卖公司佣金收入需要按照国家税法进行正常缴税，其所得需进行税收减免和缴纳其他各类税费。拍卖公司应当主动配合税务部门做好相关税收工作，切实履行企业社会责任，提高企业形象。以上是拍卖公司佣金收入如何缴税的相关介绍，有待社会各界共同探讨和完善。