首先，建筑企业跨省设立项目部时需要按照国家的法律法规缴纳企业所得税。企业所得税按照企业所得额的一定比例征收，税率一般为25%。在实际缴纳过程中，建筑企业需要根据自身经营状况和所得额来确定具体的税款金额。
其次，为了确保正常缴纳企业所得税，建筑企业跨省设立项目部需要将自身纳税情况和税款缴纳记录完善记录下来。同时，还需遵守国家有关纳税规定，按照规定时间和方式进行申报和缴纳税款，避免出现滞纳金等相关问题。
最后，建筑企业跨省设立项目部需要了解相关的税收优惠政策。在企业所得税方面，国家为鼓励企业发展提供了许多税收优惠政策，如国际税收协定、高新技术企业优惠政策等。建筑企业可以根据自身情况选择适合自己的税收优惠政策来降低税负。
总之，建筑企业跨省设立项目部是企业发展的一个必然趋势，缴纳企业所得税也是企业经营不可或缺的一环。建筑企业需要了解国家的税收政策和规定，制定科学合理的纳税方案，确保企业缴纳税款合规合法，以保障企业的健康发展。