首先，需要考虑的是事业单位的规模和职工数量。职工数量是决定代表比例的重要因素。较小的单位，代表比例可以适当增加，而较大的单位，代表比例可以适当减少。但是，需要注意的是，代表数量不能过多或过少，否则会影响代表的工作效率，如果代表数量过多，可能会产生代表间的矛盾和利益冲突，如果代表数量过少，可能会使得代表的声音不够强大。
其次，还需要考虑事业单位的性质和发展方向。在满足基本代表数量要求的前提下，需要根据单位的性质、职能和特点等因素，灵活确定代表数量比例。例如，医院和学校等服务性单位，需要在代表数量比例中适当增加医护人员和教师等专业人员的代表数量，以便更好地反映他们的利益和诉求。此外，发展方向也是非常重要的一点，需根据单位发展的未来趋势，来适当调整代表比例。
最后，代表比例还需要考虑情况的复杂性和影响的大小。例如，一个从事环保工作的事业单位，其代表身份的重要性要大于一个从事文化传媒的单位。同时，事业单位的内部结构、文化氛围、管理方式等因素也需考虑在内。
综上所述，确定事业单位职工代表比例，需要充分考虑单位性质、规模、职工数量、发展方向等因素，尽量使得代表数量合理、平衡，同时也要考虑到代表身份的重要性和影响大小。这样，才能让职工代表的工作更加具有代表性和权威性。