首先，我们需要通过电话或邮件的方式与客户沟通，了解他们未能及时寄回发票的具体原因。如果客户因为遗忘或者时间紧迫等原因导致未能寄回发票，我们可以适当给予延期，以便客户更好的处理这个问题。
其次，如果客户无法及时寄回发票的原因是由于发票遗失或者邮寄出现了问题，我们可以对客户提供发票重开的服务。同时，在重开之前需要让客户签署一份确认文件，确保我们已经将重开的发票寄送给客户了。
最后，对于那些恶意拖欠房租发票的客户，我们需要使用更为严厉的方式进行处理。可以对其进行警告、罚款等处罚措施，确保我们的权益得到保障。
总之，在处理客户未能及时寄回房租发票问题时，我们需要理性分析客户的具体情况，并作出合理的措施。同时，确保我们的权益得到有效的保护，以维护我们的经济利益。